ใช้เป็นตัวกลางสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะในกลุ่มยาที่มีโครงสร้างพิเพอราซีนและไพริไมดีน ซึ่งมักพบในยาที่ออกฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลาง เช่น ยาต้านอาการทางจิต ยาต้านอาการซึมเศร้า และยาต้านมะเร็ง โครงสร้างที่มีหมู่ tert-butoxycarbonyl (Boc) ช่วยป้องกันไนโตรเจนในพิเพอราซีนระหว่างกระบวนการสังเคราะห์ ทำให้ควบคุมปฏิกิริยาได้ดีขึ้น และสามารถถอดหมู่ป้องกันออกได้ง่ายในขั้นตอนต่อไป ส่วนหมู่คาร์บอกซิลิกแอซิดที่ปลายสายโซ่สามารถทำปฏิกิริยากับอะมีนหรือแอลกอฮอล์เพื่อสร้างอะไมด์หรือเอสเทอร์ ซึ่งเป็นโครงสร้างที่พบบ่อยในสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ จึงนิยมใช้ในขั้นตอนการสร้างสารต้นแบบ (lead compound) สำหรับการค้นคว้ายาใหม่