ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบเภสัชภัณฑ์ โดยเฉพาะในการพัฒนายับยั้ง kinase สำหรับการรักษามะเร็ง ทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในเคมีทางการแพทย์เนื่องจากแกนอินดาโซล ซึ่งเป็นที่รู้จักในการโต้ตอบกับเป้าหมายทางชีวภาพ เช่น เอนไซม์และตัวรับ โครงสร้างอนุพันธ์ของมันถูกสำรวจในการวิจัยสำหรับสารต้านการอักเสบ ต้านไวรัส และต้านการเสื่อมของระบบประสาท นอกจากนี้ยังใช้ในการสร้างยาโมเลกุลขนาดเล็กที่มุ่งเป้าไปยังโรคทางระบบประสาทและโรคเมแทบอลิซึม ใช้อย่างแพร่หลายในการศึกษาความสัมพันธ์ระหว่างโครงสร้างและกิจกรรม (SAR) เพื่อเพิ่มประสิทธิภาพและความจำเพาะของยา