ใช้เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายากำจัดศัตรูพืชและโมเลกุลที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ หมู่ไตรฟลูออร์เมทิลช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและลิโพฟิลิก ทำให้มีคุณค่าในการปรับปรุงยาที่เป็นผู้สมัคร ใช้อย่างแพร่หลายในเคมียารักษาเพื่อสร้างสารประกอบพื้นฐานพิริไมดีนที่มีศักยภาพต้านไวรัส ต้านแบคทีเรีย หรือต้านมะเร็ง นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมลิแกนด์สำหรับการเร่งปฏิกิริยาและในวิทยาศาสตร์วัสดุเพื่อออกแบบโมเลกุลอินทรีย์ฟังก์ชันนัลที่มีคุณสมบัติอิเล็กทรอนิกส์ที่ดีขึ้น