ใช้หลัก ๆ ในงานสังเคราะห์อินทรีย์ในฐานะสารเคมีที่มีซีลีเนียม ซึ่งช่วยในการนำฟังก์ชันซีลีเนียมเข้าไปในโมเลกุล สิ่งนี้มีคุณค่าในการพัฒนายาและสารประกอบชีวภาพ โครงสร้างของซีลีโนมอร์โฟลีนช่วยให้เข้าร่วมในปฏิกิริยาการสร้างวงแหวน และทำหน้าที่เป็นบล็อกก่อสร้างในเคมีเฮเทอโรไซคลิก เนื่องจากคุณสมบัติ redox ที่ไม่เหมือนใครของซีลีเนียม สารเช่นนี้ถูกสำรวจในเคมียารักษาโรคสำหรับศักยภาพในการต้านอนุมูลอิสระและการปรับเปลี่ยนกิจกรรมเอนไซม์ เช่น การเพิ่มกิจกรรมของกลูตาไธโอนเพอร์ออกซิเดสเพื่อลดความเครียดจากออกซิเจนในเซลล์ นอกจากนี้ ยังอาจใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารต้านจุลชีพและต้านมะเร็ง และทำหน้าที่เป็นลิแกนด์หรือสารกลางในปฏิกิริยาคะตะไลติกที่เกี่ยวข้องกับโลหะทรานซิชัน