ใช้เป็นสารประกอบพื้นฐานแบบ chiral ในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนาสารออกฤทธิ์ทางเภสัชกรรม (APIs) ที่ต้องการการควบคุมสเตอรีโอเคมี โครงสร้างเพอร์พิราซีนที่แข็งและมีสเตอรีโอเคมีที่กำหนดไว้ทำให้มีคุณค่าต่อเคมียาในการออกแบบยาที่มี selectivity และความเสถียรทางเมแทบอลิซึมที่ดีขึ้น ใช้บ่อยในการเตรียมตัวยับยั้งไคเนสและสารสำหรับระบบประสาทส่วนกลาง นอกจากนี้ยังใช้ในกระบวนการสังเคราะห์แบบอะซิมเมตริกและเป็นสารตั้งต้นสำหรับลิแกนด์ในปฏิกิริยาคาตาลิติก