ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์ทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะอย่างยิ่งในฐานะ chiral building block สำหรับ active pharmaceutical ingredients (APIs) โครงสร้างที่มีฟลูออรีนช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและ bioavailability ในยาที่กำลังพัฒนา ใช้อย่างแพร่หลายในการพัฒนายากลุ่ม central nervous system agents, ยาต้านไวรัส, และ enzyme inhibitors ความจำเพาะทาง stereochemistry และการแทนที่ด้วยฟลูออรีนทำให้มีคุณค่าต่อการปรับปรุง potency และ selectivity ของยา นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยเคมีทางการแพทย์สำหรับการศึกษา structure-activity relationship (SAR)