ใช้เป็นสารตั้งต้นแบบ chiral ในการสังเคราะห์เภสัชภัณฑ์ โดยเฉพาะในการพัฒนายับยั้งโปรติเอสและโมเลกุลชีวภาพอื่นๆ ความจำเพาะทาง stereochemistry ทำให้มีคุณค่าในการสร้างสารบริสุทธิ์แบบ enantiomer ใช้อย่างแพร่หลายในเคมีทางการแพทย์สำหรับการศึกษาความสัมพันธ์ระหว่างโครงสร้างและกิจกรรม เนื่องจากความเสถียรและความแข็งตัวของ conformation ในวงแหวนโมร์โฟลีน ทำหน้าที่เป็นสารกลางในการเตรียมยาที่เล็งเป้าไปยังการติดเชื้อไวรัสและความผิดปกติทางเมแทบอลิซึม หมู่ Boc ที่ป้องกันอะมีนช่วยให้สามารถถอดการป้องกันแบบเลือกสรรและปรับแต่งเพิ่มเติมในกระบวนการสังเคราะห์หลายขั้นตอน