ใช้ในสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะเป็นสารตั้งต้นหรือตัวกลางในการผลิตยาที่ต้องการโครงสร้างโมเลกุลแบบไม่สมมาตร ซึ่งความเป็นเอกลักษณ์ของหมู่ไซยาโนและโครงสร้างโมร์โฟลีนทำให้มีความเหมาะสมในการสร้างพันธะกับสารอื่นในขั้นตอนการสังเคราะห์ นิยมใช้ในงานวิจัยและพัฒนายาใหม่ที่ต้องการความเฉพาะเจาะจงสูง เช่น ยาต้านมะเร็ง หรือยาแก้โรคระบบประสาท โดยสามารถปรับเปลี่ยนโครงสร้างได้ง่ายเพื่อให้ได้สารอนุพันธ์ที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพต้องการ