ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะในงานวิจัยด้านยาที่เกี่ยวข้องกับระบบประสาทส่วนกลาง เช่น ยาต้านภาวะซึมเศร้า ยาคลายกังวล หรือยาต้านจิตประสาท เนื่องจากโครงสร้างของมันสามารถจับกับตัวรับสารสื่อประสาทบางชนิดในสมองได้ ทำให้เป็นโมเลกุลที่น่าสนใจในงานพัฒนายาใหม่ นอกจากนี้ยังใช้ในห้องปฏิบัติการวิจัยเพื่อศึกษาโครงสร้าง-กิจกรรมของสารพิเพอร์ราซีนที่มีฤทธิ์เฉพาะทาง