ใช้ในงานวิจัยด้านเภสัชกรรมเป็นสารตั้งต้นหรือตัวกลางในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะในกลุ่มยาที่เกี่ยวข้องกับระบบประสาทส่วนกลาง เช่น ยาต้านอาการซึมเศร้า ยากระตุ้นประสาท หรือยาปรับสมดุลทางจิตใจ โครงสร้างที่มีพิเพอริโดนและหมู่กรดคาร์บอกซิลิกทำให้มีศักยภาพในการจับกับตัวรับหรือเอนไซม์เฉพาะในร่างกาย จึงนิยมใช้ในขั้นตอนการพัฒนายาใหม่ในห้องปฏิบัติการ ไม่ใช่ผลิตภัณฑ์สำเร็จรูปสำหรับการใช้งานทางการแพทย์โดยตรง