ใช้เป็นสารกลางในกระบวนการสังเคราะห์สารอินทรีย์ โดยเฉพาะในการผลิตยาเภสัชกรรม ทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานสำหรับส่วนผสมยาสำคัญ (API) เนื่องจากโครงสร้าง morpholine ซึ่งพบได้บ่อยในยาที่กำหนดเป้าหมายโรคระบบประสาทส่วนกลางและยาต้านการอักเสบ นอกจากนี้ยังใช้เป็นตัวเร่งปฏิกิริยาหรือสารเติมในปฏิกิริยาการเกิดพอลิเมอร์และในการพัฒนาสารเคมีเกษตร หน้าที่ของเอเทอร์และอะมีนช่วยเพิ่มความสามารถในการละลายและปฏิกิริยาในเส้นทางสังเคราะห์ต่างๆ