ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายาต้านโปรโตซัวและยาต้านจุลชีพ โครงสร้างนิโทรอิเมดาโซลของมันมีส่วนช่วยในการออกฤทธิ์ทางชีวภาพต่อเชื้อก่อโรคแบบไม่ใช้ออกซิเจน ใช้กันทั่วไปในงานวิจัยเพื่อออกแบบยาใหม่ที่เล็งเป้าไปที่การติดเชื้อปรสิต เช่น ไการ์เดียและทริโคโมแนส นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมอนุพันธ์อิเมดาโซลที่ถูกปรับแต่งสำหรับเคมียาและการคัดกรองทางชีวภาพ