ใช้เป็นสารกลางในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายาที่ได้จากเบนซิมิดาโซลซึ่งแสดงฤทธิ์ต้านปรสิต ต้านไวรัส หรือต้านมะเร็ง กลุ่มฟังก์ชันไฮดรอกซิลและอัลลิลช่วยให้สามารถดัดแปลงทางเคมีเพิ่มเติมได้ ทำให้มีคุณค่าในการเคมียารักษาเพื่อสร้างห้องสมุดสารประกอบ นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยเพื่อออกแบบตัวยับยั้งเอนไซม์หรือลิแกนด์รีเซพเตอร์ เนื่องจากแกนเบนซิมิดาโซลมีความสัมพันธ์กับเป้าหมายทางชีวภาพ