ใช้เป็นสารกลางในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะยาต้านไวรัสและยาต้านมะเร็ง ทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในการเตรียมอนุพันธ์นิวคลีโอไซด์ ซึ่งเลียนแบบนิวคลีโอไซด์ตามธรรมชาติและรบกวนการสืบพันธุ์ของไวรัสหรือการเพิ่มจำนวนเซลล์มะเร็ง พบการใช้งานทั่วไปในงานวิจัยที่เกี่ยวข้องกับตัวยับยั้งคินาสและยาต้านปรสิต นอกจากนี้ยังใช้ในอุตสาหกรรมเกษตรเคมีสำหรับพัฒนายาฆ่าเชื้อรา เนื่องจากความสามารถในการรบกวนระบบเอนไซม์ของจุลินทรีย์ หน้าที่ของอะไมด์และอิมิดาโซลทำให้มีคุณค่าในเคมียารักษาโรคสำหรับเพิ่มความละลายและความสามารถในการจับมัด