ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์ยาเภสัชภัณฑ์ โดยเฉพาะยาที่มีโครงสร้างเบสเพอรีน (purine-based drugs) ซึ่งช่วยในการสร้างอนุพันธ์ที่มีศักยภาพในการต้านไวรัส ต้านมะเร็ง หรือยาที่กดภูมิคุ้มกัน หมู่คลอโรที่ตำแหน่ง 2 และ 6 รวมถึงหมู่เอสเตอร์ ช่วยให้สามารถดัดแปลงเลือกสรรได้ เช่น การแทนที่ด้วยหมู่อะมิโนหรือหมู่ไฮดรอกซี ทำให้มีคุณค่าในเคมีเภสัชสำหรับการสร้างระบบเฮเทอโรไซคลิกที่ซับซ้อน นิยมใช้ในงานวิจัยเพื่อพัฒนาอนุพันธ์นิวคลีโอไซด์และตัวยับยั้งคินาส