ใช้เป็นสารกลางในการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะในการพัฒนายาต้านไวรัสและยาต้านมะเร็ง หมู่ไนโตรที่ตำแหน่ง 5 และหมู่คาร์บอกซิเลตเอทิลที่ตำแหน่ง 2 ช่วยให้สามารถทำการปรับเปลี่ยนทางเคมีได้หลากหลาย ทำให้มีคุณค่าในเคมียารักษาโรคสำหรับการสร้างยาที่มีฐานไพริมิดีน ใช้บ่อยในปฏิกิริยาที่เกี่ยวข้องกับการแทนที่นิวคลีโอฟิลิกหรือการเกิดวงแหวนเพื่อสร้างระบบเฮเทอโรไซคลิกแบบหลอมรวม นอกจากนี้ยังใช้ในการวิจัยเกษตรเคมีสำหรับการออกแบบโมเลกุลที่มีฤทธิ์ชีวภาพสำหรับสารกำจัดศัตรูพืชหรือสารกำจัดวัชพืช