ใช้เป็นสารตัวกลางสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายับยั้งคินาสและยาต้านไวรัส โครงสร้างของมันช่วยให้สามารถทำการฟังก์ชันนาไลเซชันแบบเลือกเพศได้ โดยเฉพาะผ่านปฏิกิริยาแทนที่นิวคลีโอไฟล์ที่ตำแหน่งคลอไรด์ 2 ซึ่งสามารถถูกแทนที่ด้วยหมู่อะมิโนหรือหมู่ไฮดรอกซิล ทำให้มีคุณค่าในการสร้างยาที่มีฐานพิริมิดีน ใช้กันทั่วไปในเคมียารักษาโรคสำหรับบล็อกก่อสร้างในเทอราพีแบบกำหนดเป้าหมาย รวมถึงสารประกอบต้านมะเร็งและต้านการอักเสบ นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยด้านเกษตรเคมีสำหรับออกแบบยาฆ่าแมลงใหม่ เนื่องจากความตอบสนองและความเสถียรในปฏิกิริยาคัปปลิง