ใช้เป็นสารตัวกลางในการสังเคราะห์สารอินทรีย์ โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมสำหรับการเตรียมโมเลกุลที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ ทำหน้าที่เป็นบล็อกก่อสร้างแบบคีรอลในการพัฒนายาที่มุ่งเป้าไปยังความผิดปกติของระบบประสาทส่วนกลาง โครงสร้างแหวนมอร์โฟลีนช่วยเพิ่มความละลายและความเสถียรทางเมแทบอลิซึมในยาที่เป็นผู้สมัคร นอกจากนี้ยังใช้ในการสังเคราะห์สารเคมีเกษตรและวัสดุฟังก์ชันนัลเนื่องจากความแข็งแรงของโครงสร้างและวงแหวนเฮเทอโรไซคลิกที่มีไนโตรเจน