ใช้หลัก ๆ เป็นสารกลางในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายาต้านความดันโลหิตสูงและตัวยับยั้ง alpha-adrenergic เป็นส่วนประกอบหลักในการเตรียมยาที่มีโครงสร้างฐานควินาโซลีน ซึ่งมีฤทธิ์ในการบำบัดโรคระบบหัวใจและหลอดเลือดเช่นเดียวกับระบบประสาทส่วนกลาง กลุ่ม chloromethyl ที่ทำปฏิกิริยาได้ง่ายช่วยให้สามารถทำการอัลคิเลชันหรือการจับคู่กับหมู่อื่น ๆ ได้สะดวก ทำให้มีคุณค่าต่อเคมีเภสัชกรรมในการสร้างโมเลกุลยาที่ซับซ้อน นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยเพื่อพัฒนาสารชีวภาพใหม่และในการสร้างคลังสารสำหรับการคัดกรองแบบความเร็วสูงในการค้นพบยา