เบนโซฟูรอกซานถูกใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบฮีเทอโรไซคลิก โดยเฉพาะในงานวิจัยด้านเภสัชกรรมเพื่อพัฒนาสารที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ เช่น สารต้านจุลชีพ หรือสารต้านการอักเสบ นอกจากนี้ยังใช้ในปฏิกิริยาเคมีที่ต้องการกลุ่มฟังก์ชันที่มีความสามารถในการให้หรือรับอิเล็กตรอน ซึ่งช่วยส่งเสริมการเกิดปฏิกิริยาออกซิเดชันหรือรีดักชันในสภาวะเฉพาะ ยังมีการประยุกต์ใช้ในงานวัสดุศาสตร์เพื่อสร้างสารประกอบที่มีคุณสมบัติพิเศษ เช่น วัสดุที่ไวต่อแรงกระแทกหรือสารเร่งปฏิกิริยาในระบบพลังงานสูง