ใช้ในงานวิจัยด้านชีวเคมีและเภสัชกรรมเป็นหลัก โดยสารนี้มีศักยภาพในการเป็นสารตั้งต้นหรือสารกลางในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะในกลุ่มของสารที่ออกฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลาง เช่น สารที่มีผลต่อตัวรับเซโรโทนินหรือตัวรับกรดอะมิโนกรดแกมมา-อะมิโนบิวทิริก (GABA) อาจนำไปพัฒนาเป็นยารักษาโรคทางจิตเวช โรคซึมเศร้า หรือโรควิตกกังวลได้ นอกจากนี้ยังใช้เป็นโมเลกุลแทรก (molecular probe) ในการศึกษาการทำงานของเอนไซม์หรือตัวรับในเซลล์ เนื่องจากโครงสร้างของเบนซอกซาโซลสามารถเข้าจับกับเป้าหมายเฉพาะในร่างกายได้ดี ทำให้มีประโยชน์ในการพัฒนายาเฉพาะทางและงานวิจัยด้านโมเลกุลชีววิทยา