4-Chloroisothiazole-5-carboxylic acid ถูกใช้หลักในการสังเคราะห์ยา โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการผลิตส่วนผสมยาสำคัญ (APIs) ต่างๆ โครงสร้างของมันมีคุณค่าอย่างยิ่งในการพัฒนายาต้านจุลชีพและยาต้านเชื้อรา ซึ่งช่วยในการสร้างยาที่เล็งเป้าไปยังเชื้อก่อโรคที่ดื้อยา นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในการวิจัยสารเคมีเกษตรสำหรับการปรุงสูตรยาฆ่าแมลงและวัชอุทิศ โดยใช้คุณสมบัติทางเคมีเพื่อเพิ่มประสิทธิภาพและความเสถียร ในด้านวิทยาศาสตร์วัสดุ มันถูกนำไปใช้ในการพัฒนาหุ้มผิวและโพลิเมอร์เฉพาะทาง ซึ่งกลุ่มฟังก์ชันของมันช่วยปรับปรุงลักษณะการทำงาน เช่น ความทนทานและความต้านทานต่อปัจจัยสิ่งแวดล้อม