2-Bromothieno[3,2-c]pyridin-4-amine ใช้เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบเภสัชกรรมต่างๆ โดยเฉพาะอย่างยิ่งสำหรับโรคทางระบบประสาท โครงสร้างของมันมีคุณค่าในการพัฒนายับยั้ง kinase ซึ่งสำคัญในการบำบัดมะเร็ง นอกจากนี้ ยังใช้เป็นบล็อกก่อสร้างในเคมีอินทรีย์สำหรับสร้างสารประกอบเฮเทโรไซคลิกซับซ้อนที่มีกิจกรรมทางชีวภาพ อะตอมโบรมีนช่วยให้สามารถทำหน้าที่เพิ่มเติม ทำให้มีความยืดหยุ่นในการค้นพบยาและการวิจัยเคมียารักษา