tert-Butyl 2-cyanomorpholine-4-carboxylate เป็นสารเคมีที่ใช้หลักเป็นสารกลางในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในการพัฒนายาเภสัชกรรม โครงสร้างของมันซึ่งมีทั้งกลุ่มไซยาโนและวงแหวนมอร์โฟลีน ทำให้มีคุณค่าในการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อน มันมักใช้ในการสังเคราะห์ส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) ที่ต้องการอนุพันธ์มอร์โฟลีน นอกจากนี้ ยังสามารถเป็นบล็อกก่อสร้างในการเตรียมสารที่มีศักยภาพทางชีวภาพ เช่น ตัวยับยั้งหรือตัวปรับของเอนไซม์หรือตัวรับเฉพาะ กลุ่มเอสเตอร์เทอร์ต-บิวทิลยังให้ความเสถียรและความยืดหยุ่นในเส้นทางสังเคราะห์ อนุญาตให้ทำการปรับแต่งเพิ่มเติมในปฏิกิริยาหลายขั้นตอน