เฮมาทินพอร์ซีนใช้หลักในการวิจัยทางการแพทย์และชีวเคมี โดยทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบสำคัญในการศึกษาที่เกี่ยวข้องกับเมแทบอลิซึมของฮีมและบทบาทของมันในกระบวนการทางชีวภาพต่างๆ ในสถานพยาบาล มันถูกนำมาใช้ในการรักษาโรคเช่น พอร์ไฟเรียเฉียบพลัน ซึ่งช่วยลดการผลิตสารตั้งต้นของพอร์ไฟรินโดยการยับยั้งเอนไซม์ ALA synthase สิ่งนี้ช่วยบรรเทาอาการและป้องกันภาวะแทรกซ้อนเพิ่มเติม นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในการทดลองในห้องปฏิบัติการเพื่อเลียนแบบโปรตีนที่มีฮีม ช่วยในการทำความเข้าใจการขนส่งออกซิเจนและหน้าที่ของเอนไซม์ การประยุกต์ใช้ยังขยายไปสู่การพัฒนาเครื่องมือวินิจฉัยและยารักษาที่มุ่งเป้าไปยังความผิดปกติที่เกี่ยวข้องกับฮีม