ใช้เป็นตัวกลางสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายับยั้ง kinase และสารประกอบที่มีกิจกรรมทางชีวภาพอื่นๆ โครงสร้างของสารนี้ช่วยให้สามารถทำการฟังก์ชันนาไลเซชันแบบเลือกเพศได้ ทำให้มีคุณค่าในเคมียารักษาเพื่อสร้างอนุพันธ์ที่มีประสิทธิภาพสูงขึ้นและความเสถียรทางเมแทบอลิซึมที่ดีกว่า ใช้บ่อยในการเตรียมสารเคมีเกษตรและสารประกอบเฮเตอร์โรไซคลิกพิเศษที่การแทนที่ด้วยฟลูออรีนช่วยเพิ่มปฏิกิริยาหรือความสัมพันธ์ในการจับ นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยเพื่อสร้างโมเลกุลซับซ้อนผ่านปฏิกิริยาครอส-คัปพลิงและการแทนที่แบบนิวคลีโอฟิลิก หมู่ฟลูออรีนและหมู่เอสเทอร์ช่วยเพิ่มความสามารถในการผ่านเยื่อหุ้มเซลล์และความจำเพาะต่อเป้าหมายทางชีวภาพ