ใช้หลักๆ เป็นสารกลางในการสังเคราะห์เภสัชภัณฑ์และสารเคมีเกษตร โครงสร้างของมันช่วยให้สามารถปรับแต่งหน้าที่เพิ่มเติมได้ ทำให้มีคุณค่าในการพัฒนาส่วนผสมออกฤทธิ์ในผลิตภัณฑ์ป้องกันพืชและยาที่มีศักยภาพบางชนิด การมีฟลูออรีนช่วยเพิ่มการดูดซึมทางชีวภาพและความเสถียรภาพทางเมแทบอลิซึมในโมเลกุลเป้าหมาย ใช้บ่อยในปฏิกิริยาที่เกี่ยวข้องกับการแทนที่อะโรมาติกแบบนิวคลีโอฟิลิกหรือการรีดิวซ์หมู่ไนโตรเพื่อสร้างเอมีน