ใช้เป็นหลักเป็นสารกลางในการสังเคราะห์ยาเภสัชภัณฑ์และสารเคมีเกษตรที่ฟลูออรีน หมู่ย่อยไอโอดีนและฟลูออรีนทำให้เหมาะสำหรับปฏิกิริยาคัปปลิ้งและการแปลงหมู่ฟังก์ชันในสังเคราะห์อินทรีย์ ใช้บ่อยในการเตรียมบล็อกก่อสร้างฟลูออรีนสำหรับพัฒนายา ซึ่งอะตอมฟลูออรีนช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและ bioavailability นอกจากนี้ยังใช้ในการผลิตฟลูออโรเอลาสโตเมอร์และสารลดแรงตึงผิวเฉพาะทางที่ต้องการความทนทานต่อความร้อนและสารเคมี ความตอบสนองของมันช่วยให้สามารถนำเข้าโมเลกุลใหญ่ได้ง่ายผ่านการแทนที่นิวคลีโอฟิลิกหรือกระบวนการครอส-คัปปลิ้งที่เร่งด้วยโลหะ