5-Fluoro-2-iodobenzoic acid เป็นสารประกอบที่นำมาใช้หลักๆ ในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะอย่างยิ่งเป็นบล็อกก่อสร้างสำหรับโมเลกุลที่ซับซ้อนมากขึ้น มักถูกนำไปใช้ในการพัฒนายา โดยโครงสร้างของมันทำหน้าที่เป็นตัวกลางสำคัญในการสังเคราะห์ส่วนผสมยาสำคัญ (APIs) การมีอะตอมฟลูออรีนและไอโอดีนทั้งคู่ทำให้มีคุณค่าต่อการนำฮาโลเจนเหล่านี้เข้าไปในโมเลกุลเป้าหมาย ซึ่งสามารถเพิ่มกิจกรรมทางชีวภาพหรือปรับเปลี่ยนคุณสมบัติเภสัชจลนศาสตร์ นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในวิทยาศาสตร์วัสดุสำหรับการเตรียมโพลิเมอร์และสารเคลือบพิเศษ โดยคุณสมบัติทางเคมีที่เป็นเอกลักษณ์ของมันช่วยสนับสนุนลักษณะที่ต้องการของผลิตภัณฑ์สุดท้าย