เอทิล 3-ฟลูออโร-2-ไนโตรเบนโซเอต ใช้หลักๆ เป็นสารกลางในกระบวนการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในการผลิตยาและสารเคมีเกษตร โครงสร้างของมันที่มีทั้งกลุ่มไนโตรและสารย่อยฟลูออโร ทำให้เป็นบล็อกก่อสร้างที่มีคุณค่าสำหรับการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อนมากขึ้น มันมักถูกใช้ในการพัฒนาส่วนผสมยาสำคัญ (APIs) โดยที่กลุ่มไนโตรสามารถถูกย่อให้เป็นอะมีน ทำให้สามารถทำการฟังก์ชันนัลไลเซชันเพิ่มเติม นอกจากนี้ สารประกอบนี้ยังถูกใช้ในสถานที่วิจัยสำหรับศึกษากลไกปฏิกิริยาและพัฒนาเส้นทางสังเคราะห์ใหม่ๆ บทบาทของมันในการสังเคราะห์สารเคมีละเอียดและสารประกอบพิเศษเน้นย้ำถึงความสำคัญในเคมีอุตสาหกรรมและวิชาการ