4-amino-3,5-difluorobenzoic acid ใช้เป็นสารกลางในการสังเคราะห์เภสัชภัณฑ์ โดยเฉพาะในการพัฒนาสารออกฤทธิ์ทางเภสัชกรรม (APIs) มีบทบาทในการผลิตสารประกอบที่มีศักยภาพในการรักษา เช่น ยาต้านการอักเสบหรือยาต้านมะเร็ง นอกจากนี้ ยังใช้ในการวิจัยเคมีอินทรีย์สำหรับการเตรียมโมเลกุลที่ซับซ้อน รวมถึงสารประกอบที่มีการแทนที่ด้วยฟลูออรีน ซึ่งมักถูกสำรวจเพื่อคุณสมบัติทางเคมีและชีวภาพที่เป็นเอกลักษณ์ กลุ่ม difluoro และ amino ทำให้เป็นบล็อกก่อสร้างที่มีคุณค่าสำหรับเคมียารักษาและการค้นพบยา