5-Chlorosulfonyl-2-fluorobenzoic acid ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์อินทรีย์ ซึ่งมีบทบาทสำคัญในการผลิตเภสัชภัณฑ์และสารเคมีเกษตรต่างๆ กลุ่ม chlorosulfonyl และกรดคาร์บอกซิลิกที่ทำปฏิกิริยาได้ทำให้เป็นบล็อกก่อสร้างที่หลากหลายสำหรับการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อน ในอุตสาหกรรมเภสัชกรรม มักใช้ในการพัฒนาส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) ที่มีคุณสมบัติทางรักษาเฉพาะ เช่น ยาต้านการอักเสบหรือยาต้านจุลินทรีย์ นอกจากนี้ ยังนำไปใช้ในการสังเคราะห์สีย้อมและเม็ดสี ซึ่งช่วยในการให้สีแก่สารถูกในกระบวนการอุตสาหกรรม โครงสร้างฟลูออรีนยังช่วยเพิ่มความเสถียรและการดูดซึมทางชีวภาพของผลิตภัณฑ์สุดท้าย ทำให้มีคุณค่าต่อการวิจัยและพัฒนาเคมีขั้นสูง