ใช้เป็นตัวกลางสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายากลุ่มระบบประสาทส่วนกลางและยาต้านอาการซึมเศร้า โครงสร้างอะโรมาติกที่มีฟลูออรีนช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและการดูดซึมทางชีวภาพในโมเลกุลยา ใช้บ่อยในการเตรียมตัวยับยั้งการดูดซึมเซโรโทนินแบบเลือกเฉพาะ (SSRIs) และสารประกอบชีวภาพอื่นๆ โดยการแทนที่ด้วยฟลูออรีนช่วยปรับปรุงความสัมพันธ์ในการจับและคุณสมบัติเภสัชจลนศาสตร์ นอกจากนี้ยังใช้ในสารเคมีเกษตรสำหรับการผลิตสารกำจัดวัชพืชและยาฆ่าเชื้อรา เนื่องจากความสามารถในการปรับความหนาแน่นของอิเล็กตรอนในส่วนประกอบที่ใช้งาน เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในวัสดุผลึกเหลวสำหรับเทคโนโลยีแสดงผล ช่วยเพิ่มความเสถียรทางความร้อนและเคมี