ใช้เป็นสารกลางในการสังเคราะห์เภสัชภัณฑ์และสารเคมีเกษตร โครงสร้างอะโรมาติกที่ถูกฮาโลเจนแทนที่ทำให้มีคุณค่าต่อปฏิกิริยาการจับคู่ข้าม เช่น ปฏิกิริยา Suzuki หรือ Heck เพื่อสร้างโมเลกุลอินทรีย์ที่ซับซ้อน ใช้กันทั่วไปในการพัฒนาส่วนประกอบออกฤทธิ์สำหรับผลิตภัณฑ์ป้องกันพืช และในเคมีทางการแพทย์สำหรับการสร้างยาตัวสมัครที่มุ่งเป้าไปยังความผิดปกติจากการอักเสบและระบบประสาทส่วนกลาง การมีฮาโลเจนหลายตัวช่วยให้สามารถทำการฟังก์ชันนาไลเซชันแบบเลือกเฉพาะได้ ซึ่งช่วยให้ปรับแต่งคุณสมบัติของโมเลกุลอย่างละเอียดในขั้นตอนการปรับปรุง