ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารเคมีเกษตรและเภสัชภัณฑ์ โดยเฉพาะในการพัฒนายาฆ่าหญ้าและสารควบคุมการเจริญเติบโตของพืช โครงสร้างอะโรมาติกที่มีฟลูออรีนช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและการดูดซึมทางชีวภาพในสารออกฤทธิ์ที่ใช้งานได้ มักใช้ในการผลิตยาฆ่าหญ้าชนิดซัลโฟนิลยูเรีย ซึ่งทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบหลักในการสร้างระบบแหวนเฮเทอโรไซคลิกหลัก นอกจากนี้ยังใช้ในเคมียารักษาเพื่อออกแบบตัวยับยั้งเอนไซม์ เนื่องจากความสามารถในการปรับเปลี่ยนความสัมพันธ์การจับและลิโพฟิลิก