ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยาที่มีฟลูออรีน โดยเฉพาะอย่างยิ่งในการพัฒนายาต้านการอักเสบที่ไม่ใช่สเตียรอยด์ (NSAIDs) และโมเลกุลชีวภาพอื่นๆ โครงสร้างอะโรมาติกที่ถูกแทนที่ด้วยฟลูออรีนสามตำแหน่งช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและความสามารถในการซึมผ่านเยื่อหุ้มเซลล์ในตัวยาที่เป็นผู้สมัคร มักใช้ในเคมีทางการแพทย์เพื่อการศึกษาความสัมพันธ์ระหว่างโครงสร้างและกิจกรรม (SAR) เนื่องจากผลกระทบการดึงอิเล็กตรอนของอะตอมฟลูออรีน ซึ่งมีอิทธิพลต่อความเป็นกรดและความสัมพันธ์ในการจับมัด นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมสารเคมีเกษตรและโพลิเมอร์พิเศษ โดยที่การฟลูออรีนช่วยปรับปรุงความต้านทานต่อความร้อนและการออกซิเดชัน