3,4,5-ไตรเมทอกซีเบนซิล คลอไรด์ ใช้หลัก ๆ เป็นสารกลางในกระบวนการสังเคราะห์สารอินทรีย์ โดยมีบทบาทสำคัญในการผลิตยาต่าง ๆ โดยเฉพาะยาที่มุ่งเป้าไปที่ภาวะทางระบบประสาทและโรคหัวใจและหลอดเลือด โครงสร้างของมันช่วยให้สามารถนำกลุ่ม 3,4,5-ไตรเมทอกซีเบนซิล เข้าสู่โมเลกุลที่ใหญ่กว่า เพื่อเพิ่มกิจกรรมทางชีวภาพ นอกจากนี้ ยังใช้ในการพัฒนาสารเคมีเกษตร สนับสนุนการสร้างสารกำจัดวัชพืชและสารกำจัดเชื้อรา ในงานวิจัย มันทำหน้าที่เป็นบล็อกก่อสร้างสำหรับการสังเคราะห์สารประกอบที่ซับซ้อนในเคมียารักษาโรคและวิทยาศาสตร์วัสดุ การประยุกต์ใช้ยังขยายไปถึงการเตรียมสีย้อมและสารเคมีพิเศษ