2-Chloro-6-methylbenzylamine ใช้หลักในการสังเคราะห์เภสัชภัณฑ์ โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการผลิตส่วนผสมยาสำคัญ (APIs) ต่างๆ โครงสร้างของมันช่วยให้ทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานสำหรับสารประกอบที่มีศักยภาพในการรักษา โดยเฉพาะในการพัฒนายากันแพ้และยาต้านการอักเสบ นอกจากนี้ ยังมีการประยุกต์ใช้ในการวิจัยสารเคมีเกษตร โดยใช้ในการสร้างยาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืช เนื่องจากความตอบสนองทางเคมีและความสามารถในการสร้างอนุพันธ์ที่เสถียร ในด้านวิทยาศาสตร์วัสดุ ถูกใช้ในการเตรียมสารเคมีพิเศษและโพลิเมอร์ ซึ่งมีส่วนช่วยในการพัฒนาวัสดุขั้นสูงที่มีคุณสมบัติเฉพาะ ความหลากหลายในการสังเคราะห์อินทรีย์ทำให้มีคุณค่าในสถานที่วิจัยและอุตสาหกรรม