2,3-ไดฟลูออโร-6-เมทิลเบนโซไนไตริล ถูกนำมาใช้เป็นหลักในสาขาการสังเคราะห์อินทรีย์ในฐานะสารตั้งต้นที่หลากหลาย มักถูกนำไปใช้ในการพัฒนายาและสารเคมีเกษตรเนื่องจากโครงสร้างอะโรมาติกฟลูออรีนที่เป็นเอกลักษณ์ ซึ่งสามารถเพิ่มกิจกรรมทางชีวภาพและความเสถียรของสารประกอบสุดท้าย สารนี้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการสังเคราะห์ส่วนผสมออกฤทธิ์สำหรับสารกำจัดวัชพืช สารกำจัดเชื้อรา และสารกำจัดแมลง โดยอะตอมฟลูออรีนมีบทบาทสำคัญในการปรับปรุงประสิทธิภาพ นอกจากนี้ยังทำหน้าที่เป็นบล็อกก่อสร้างในการสร้างโมเลกุลซับซ้อนสำหรับเคมียารักษาโรค รวมถึงผู้สมัครยาที่มีศักยภาพในการกำหนดเป้าหมายโรคต่างๆ การประยุกต์ใช้ขยายไปสู่วิทยาศาสตร์วัสดุ ซึ่งสามารถนำไปใช้ในการพัฒนาสารเคมีพิเศษที่มีคุณสมบัติอิเล็กทรอนิกส์หรือคุณสมบัติทางแสงเฉพาะ