2,3-Difluoro-4-methoxyaniline ถูกใช้โดยหลักเป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบอินทรีย์ต่าง ๆ โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมและเคมีเกษตร โครงสร้างที่มีทั้งกลุ่มฟลูออรีนและเมทอกซี ทำให้เป็นบล็อกก่อสร้างที่มีคุณค่าสำหรับการสร้างโมเลกุลที่มีกิจกรรมทางชีวภาพเฉพาะ ในเภสัชกรรม มักใช้ในการพัฒนาส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) สำหรับยาที่เล็งเป้าไปยังโรคทางระบบประสาท การอักเสบ หรือโรคติดเชื้อ ในเคมีเกษตร ใช้เป็นสารตั้งต้นในการผลิตสารกำจัดวัชพืชและยาฆ่าแมลง โดยอะตอมฟลูออรีนช่วยเพิ่มความเสถียรและประสิทธิภาพของสารประกอบ นอกจากนี้ คุณสมบัติทางเคมีที่เป็นเอกลักษณ์ยังทำให้มีประโยชน์ในวิทยาศาสตร์วัสดุ โดยเฉพาะในการสังเคราะห์โพลิเมอร์ขั้นสูงและสีย้อมที่มีหน้าที่เฉพาะ