สารนี้ใช้หลักในการสังเคราะห์เภสัชภัณฑ์และสารเคมีเกษตรกรรมต่างๆ เนื่องจากโครงสร้างที่เป็นเอกลักษณ์ ซึ่งช่วยให้ทำหน้าที่เป็นสารกลางในปฏิกิริยาออร์แกนิกที่ซับซ้อน กลุ่มไตรฟลูออโรเมทอกซีช่วยเพิ่มกิจกรรมทางชีวภาพของสารประกอบที่สร้างขึ้น ทำให้มีคุณค่าในการพัฒนายาที่เล็งเป้าไปยังเอนไซม์หรือตัวรับเฉพาะ นอกจากนี้ ยังนำไปใช้ในการวิจัยและพัฒนาเพื่อสร้างวัสดุใหม่ที่มีคุณสมบัติเฉพาะ เช่น ความเสถียรหรือปฏิกิริยาที่ดีขึ้นในกระบวนการเคมี กลุ่มไนโตรยังมีประโยชน์ในการผลิตสีย้อมและเม็ดสี ซึ่งช่วยเพิ่มความคงทนของสีและความทนทาน