ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบอินทรีย์ที่ซับซ้อน โดยเฉพาะในงานวิจัยด้านเภสัชกรรมและสารชีวโมเลกุล สารนี้มีหมู่ไอโอดีนที่สามารถทำปฏิกิริยาแทนที่ได้ง่าย ทำให้เหมาะสำหรับการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนผ่านปฏิกิริยาเชิงพาณิชย์ เช่น ปฏิกิริยาของเฮกค์ หรือปฏิกิริยาฟูริเอร์-มอติยามะ นิยมใช้ในห้องปฏิบัติการเพื่อพัฒนาสารใหม่ที่มีโครงสร้างแนฟทาลีนเป็นแกนหลัก ซึ่งอาจนำไปสู่การค้นพบยาหรือสารที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ