ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์ยาและสารเคมีเกษตร โดยเฉพาะในการพัฒนาสารประกอบอะโรมาติกที่ถูกแทนที่ด้วยฟลูออรีนและไอโอดีน โครงสร้างของมันช่วยให้เกิดปฏิกิริยาครอส-คัปปลิ้งแบบเลือกสรร ทำให้มีคุณค่าในการสร้างโมเลกุลออร์แกนิกที่ซับซ้อน ใช้ทั่วไปในปฏิกิริยาซูซูกิและเฮ็คเพื่อนำวงแหวนอะโรมาติกที่ถูกแทนที่ด้วยคลอโรและไอโอดีนเข้าสู่สารเป้าหมาย ยังใช้ในการเตรียมสารประกอบที่ติดฉลากรังสีสำหรับการศึกษาพิมพ์ภาพ เนื่องจากไอโอดีนสามารถถูกแทนที่ด้วยไอโซโทปกัมมันตรังสีได้ อะตอมฟลูออรีนช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมในโมเลกุลชีวภาพ ทำให้มีประโยชน์มากขึ้นในเคมีเภสัชศาสตร์