2-Fluoroiodobenzene ใช้เป็นสารตั้งต้นที่หลากหลายในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะอย่างยิ่งในการพัฒนายาและสารเคมีเกษตร โครงสร้างที่เป็นเอกลักษณ์ซึ่งมีอะตอมฟลูออรีนและไอโอดีน ทำให้มีคุณค่าต่อการนำวงแหวนอะโรมาติกฟลูออรีนเข้าไปในโมเลกุลที่ซับซ้อน ซึ่งเป็นสิ่งสำคัญในการออกแบบยาเพื่อเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและการดูดซึมทางชีวภาพ นอกจากนี้ ยังทำหน้าที่เป็นสารเคมีหลักในปฏิกิริยาครอส-คัปเปลิง เช่น ปฏิกิริยา Suzuki-Miyaura และ Ullmann ซึ่งช่วยในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนและคาร์บอน-เฮเทอโรอะตอม สารประกอบนี้ยังถูกนำมาใช้ในการสังเคราะห์ผลึกเหลวและวัสดุขั้นสูง โดยใช้ประโยชน์จากคุณสมบัติทางอิเล็กทรอนิกส์สำหรับการประยุกต์ใช้เฉพาะทาง