2-Fluoro-5-iodotoluene ถูกนำมาใช้อย่างกว้างขวางในอุตสาหกรรมเคมี โดยเฉพาะในกระบวนการสังเคราะห์สารเคมีที่มีความซับซ้อน มักใช้เป็นสารตั้งต้นในการผลิตสารประกอบอินทรีย์ที่มีฟลูออรีนและไอโอดีนเป็นส่วนประกอบ ซึ่งมีประโยชน์ในด้านเภสัชกรรมและวัสดุศาสตร์ นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในการวิจัยและพัฒนายาใหม่ๆ โดยเฉพาะยาที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพเฉพาะเจาะจง เนื่องจากโครงสร้างของมันสามารถช่วยในการปรับปรุงประสิทธิภาพและความเลือกเฉพาะของยาได้ นอกจากนี้ ยังมีการประยุกต์ใช้ในกระบวนการทางเคมีวิเคราะห์และการศึกษาปฏิกิริยาเคมีต่างๆ เพื่อทำความเข้าใจกลไกและพัฒนาวิธีการสังเคราะห์ที่ใหม่และมีประสิทธิภาพมากขึ้น