ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์ยาและสารเคมีเกษตร โดยเฉพาะในปฏิกิริยาที่ต้องการการฟลูออรีนแบบเลือกสรร หน้าที่ของไอโอดีนช่วยให้เกิดปฏิกิริยาคัปปลิง เช่น Suzuki หรือ Heck couplings ซึ่งช่วยในการสร้างระบบอะโรมาติกที่ซับซ้อน ใช้กันทั่วไปในการพัฒนาส่วนประกอบออกฤทธิ์ที่มีฟลูออรีนในสารป้องกันพืชและสารยารักษา เนื่องจากอะตอมฟลูออรีนช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึม นอกจากนี้ยังใช้ในวิทยาศาสตร์วัสดุสำหรับการออกแบบผลึกเหลวและเซมิคอนดักเตอร์อินทรีย์ โดยปรับคุณสมบัติทางอิเล็กทรอนิกส์ด้วยการแทนที่ด้วยฮาโลเจน