ใช้เป็นสารตัวกลางสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนาสารออกฤทธิ์ทางเภสัชกรรมที่มีฟลูออรีน (APIs) ซึ่งอะตอมฟลูออรีนช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและการดูดซึมทางชีวภาพ หมู่ฟังก์ชันของมันช่วยให้สามารถดัดแปลงได้อย่างเลือกสรร ทำให้มีคุณค่าในการสร้างโมเลกุลซับซ้อนสำหรับการค้นคว้ายา นอกจากนี้ยังใช้บ่อยในการวิจัยสารเคมีเกษตรเพื่อสร้างยาฆ่าแมลงและวัชยาใหม่ เนื่องจากผลกระทบของฮาโลเจนรวมกันที่ช่วยเพิ่มความเลือกสรรต่อเป้าหมายและความคงทนในสิ่งแวดล้อม ยังนำไปใช้ในการเตรียมสารเคมีพิเศษสำหรับวิทยาศาสตร์วัสดุ เช่น ของเหลวผลึกหรือโพลิเมอร์ฟังก์ชัน ซึ่งต้องการสถาปัตยกรรมโมเลกุลที่แม่นยำ