ใช้เป็นสารตัวกลางหลักในการสังเคราะห์ยาและสารเคมีเกษตรที่มีฟลูออรีน โครงสร้างของมันช่วยให้สามารถทำการปรับแต่งทางเคมีแบบเลือกสรรในปฏิกิริยาการจับคู่ข้าม ทำให้มีคุณค่าในการพัฒนาโมเลกุลที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ ใช้กันทั่วไปในการเตรียมตัวยับยั้งคินาสและสารรักษาอื่นๆ โดยการแทนที่ด้วยฟลูออรีนช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและความเข้มข้นในการจับมัด นอกจากนี้ยังนำไปใช้ในการออกแบบยาฆ่าแมลงชนิดใหม่ เนื่องจากหมู่ไตรฟลูออโรมิทิลและฟลูออโรอาริลช่วยเพิ่มไลโพฟิลิกและการซึมผ่านเมมเบรน