ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายาที่มีฟลูออรีนเพื่อเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและการดูดซึมทางชีวภาพ โครงสร้างอะโรมาติกที่มีฮาโลเจนทำให้มีคุณค่าต่อปฏิกิริยาการจับคู่ เช่น ปฏิกิริยา Suzuki หรือ Ullmann สำหรับการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อนในเคมียารักษาโรค นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมสารเคมีเกษตรและวัสดุฟังก์ชันนัลเนื่องจากหมู่โบรมีนและไฮดรอกซิลที่ทำปฏิกิริยาได้ ซึ่งช่วยให้สามารถดัดแปลงทางเคมีเพิ่มเติมได้ การมีอะตอมฟลูออรีนสามารถส่งผลต่อลิโพฟิลิกและความสัมพันธ์ในการจับของผลิตภัณฑ์สุดท้าย ทำให้มีประโยชน์ในการปรับปรุงสารนำร่องระหว่างการค้นพบยา