5-Chloro-2,4-difluoroaniline ถูกนำมาใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์สารเคมีต่างๆ โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมยาและเกษตรกรรม ในด้านเภสัชกรรม มันถูกใช้ในการผลิตสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ เช่น ยาต้านเชื้อแบคทีเรียและยาต้านไวรัส นอกจากนี้ยังมีบทบาทในการสังเคราะห์สารกำจัดศัตรูพืชและสารเคมีป้องกันพืช โดยช่วยเพิ่มประสิทธิภาพและความทนทานของผลิตภัณฑ์สุดท้าย ในอุตสาหกรรมเคมีสังเคราะห์ มันยังถูกใช้ในการสร้างสารประกอบอินทรีย์ที่ซับซ้อน ซึ่งมีประโยชน์ในกระบวนการวิจัยและพัฒนา